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高温烧菌培养室温度太高，杂菌易生长；发菌期菌袋内温度升至32弋以上，没及时疏袋散热，造成烧袋，致使绿霉等杂菌严重感染。培菌时有两个升温关键期，一是菌种萌发覆盖料面后的迅速生长期；二是早春气温迅速升高。高温烧菌后，病害症状没及时表现出来，但由于灵芝菌丝受损严重，芝棒割袋下地后，病害很快爆发。芝棒菌丝体成熟度不足灵芝菌丝体成熟度不足，菌丝体抗性弱，芝棒下地、菌袋剪口后仍易感染杂菌。阳光暴晒菌袋菌袋覆土后，日照强烈，迅速升温，芝棚遮阳度小（甚至没有遮阳），致使菌袋菌丝体被太阳暴晒受损后感染杂菌。芝棒下地后灌水由于是不完全脱袋栽培，芝棒下地后灌水，菌木表面及菌袋内的水份不能很快从袋内蒸发出来，过高的土壤水份会切断段木菌丝的氧气供给，致使芝棒呼吸不畅窒息死亡后感染杂菌。防治措施针对芝棒污染原因和引发途径，生产上，要掌握灵芝品种的特征特性，提供适宜其生长的环境条件，规范操作，并贯彻为主的方针，避免或减少芝棒感染杂菌。
所选用菌材树龄以5-20年为宜，于农历9月落叶后至翌年2月抽枝前砍伐，削平树钉截成15厘米长，装入26厘米x50厘米X0.05毫米的灵芝专用栽培袋中，注意不要让木质纤维扎穿袋子，以免造成后期污染。四、混合料的加入与比例混合料是填充袋内段木与段木之间的主要物质，它是灵芝菌丝体初的营养源。其配方为：阔叶木屑75%、细米糠或麦麸21%、白糖或红糖1%、石膏1%、硫酸镁0.1%、合成色素0.3%、合成蛋白胨0.54%、灵芝生物素0.06%、腐质土1%,料水比为5：5。将硫酸镁、生物素、色素、合成蛋白胨、白糖溶入水中，与上述原料拌匀，填入已装好段木的栽培袋中，注意段木与段木之间的空隙一定要填实，料面超出段木面2厘米即可封袋，并立即进入灭菌程序。五、灭菌灭菌可采用高压或常温蒸笼，无论采用哪一种灭菌，都要考虑料之间的水蒸气流通，以收到充分灭菌的效果，
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