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袋栽与瓶栽过程相似，只是采用聚乙烯或聚氯乙烯塑料袋，装至离袋口约10cm处，收拢袋口，套塑料套环，加棉塞。灭菌，在无菌条件下接种培养。当菌丝长到袋的1/2左右时拔去棉塞和套环，露出料面，让其出芝。注意不要过早打开袋口，以免菌丝干涸而影响子实体发生。段木栽培选择栎树、榆树、桦木等阔叶树种，树龄7~10年，树径6~15cm。砍伐截段伐树在落叶后至翌年萌芽前进行，砍伐时不要损伤树皮。接种前锯成段，浸水12?15h，增加含水量，以利发菌。打孔接种用皮带冲安装在接种锤上打孔，直径约9.6?10mm，随即用接种枪接入菌种，然后用树皮盖封穴，接种选晴天进行，做到边打孔，边接种，边封穴。
使用高质量的塑料袋，减少孔使用产品质量可靠、稳定的厂家生产的塑料袋,厚度要求0.035mm~0.05mm,装袋、灭菌、接种及运输过程中要轻拿轻放，发现被段木块刺破的菌袋，须用纸胶布或透明胶布粘住菌袋砂眼或孔。灭菌彻底灭菌仓内叠放料袋时要堆叠合理，纵向每4排料袋约宽60cm作为一行，行与行之间要留有空隙，以使蒸汽均匀循环。用旺火烧到罩膜鼓起时，排出冷空气，当罩膜内温度达到100P时，连续保持24~30h，才可以停火降温;注意加温过程中要适时加水，保持水在规定的水位范围内，加水过程中要保证罩膜内温度不下降。灭菌时，防止灭菌罩膜漏气，要注意蒸汽炉的蒸汽发生量与灭菌物数量相匹配，灭菌袋数增加，应相应延长灭菌时间。接种时防止料温太高料温太高，超过38t，易烧死菌种，是在灭菌后的料袋还有余温（32~35t）时接种。提供适宜的培菌环境在培养室或塑料薄膜大棚内暗光培养，保持七分阴三分阳，以利菌丝生长。鼠害。发菌阶段，要定期检查、翻堆、通风，严防料温上升到32t以上而出现“烧菌”现象；发菌期间培养室（棚）内温度低于20t,可用火加温，每天中午通风1~2h。菌丝爬满木段后，再在弱光环境中培养20d以上，促使菌丝老化，培菌时间需2~3个
前期管理（埋棒后20天）菌袋埋土后，主要为水分、通气、温度光照三要素的调节，要保持适宜的温度、湿度、光照和控制通风量，温度要保持在22—26T，空气相对湿度要保持在85%—90%，初期以保温为主，白天拉开一层遮阳网，接受光照，避免日光直射，增加土壤温度，中午气温过高时，应开窗通风，喷水降温。在汉中约15d原基便可零星露出土表。中期管理（埋棒后20—40d）气温上升，温差较大，白天注意降温，控制温度在22—28空气相对湿度要保持在90%—95%;晚间应放下薄膜减少温差。光照采用双层遮阳网控制，制造出闪烁型林下散射光。此阶段，菌原基生长较快，每2—3d要进行通风换气，灵芝对二氧化碳非常敏感，否则，会造成灵芝菌柄长、不开伞或畸形。在此期间要定苗修头，原基生长20d后海袋选留1株强势菌株，并对其上生长点进行修头，即修成马蹄形，利于商品外形一致，提高灵芝菌盖的商品率，一般次修完后10d，应再进行一次留株修头。
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